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本院新聞
安康市農(nóng)科院魔芋科研團(tuán)隊(duì)首次完成白魔芋全基因組測(cè)序
作者： [段龍飛] 文章來(lái)源： [魔芋研究所] 點(diǎn)擊數(shù)：[1859] 更新時(shí)間：[2025-01-14]
近日，安康市農(nóng)科院魔芋科研團(tuán)隊(duì)聯(lián)合西北農(nóng)林科技大學(xué)秦寶福副教授、安康學(xué)院沈川副教授，首次完成白魔芋全基因組的測(cè)序、組裝和注釋分析。
白魔芋（Amorphophallus albus）最早由西南大學(xué)劉佩瑛教授于1984年發(fā)現(xiàn)并命名的新種，是我國(guó)特有種，主要分布于金沙江河谷流域。白魔芋抗逆性較強(qiáng)，適應(yīng)于海拔低、溫度高且日照較強(qiáng)的生長(zhǎng)環(huán)境。白魔芋品質(zhì)好，葡甘聚糖含量高達(dá)60%（干基），被成為“魔芋貴族”。
本研究選用安康市農(nóng)科院自主選育的白魔芋品種“安白芋1號(hào)”（從國(guó)內(nèi)收集的白魔芋種質(zhì)資源進(jìn)行提純復(fù)壯、優(yōu)良單株、無(wú)性系擴(kuò)繁育成的新品種，是我國(guó)首個(gè)選育保護(hù)的白魔芋品種。）為研究對(duì)象，利用DNBseq、Pacbio HiFi以及Hi-C測(cè)序技術(shù)，最終獲得了5.94 Gb白魔芋基因組，contig N50 = 5.61 Mb，scaffold N50 = 467.26 Mb，99.94%的序列被掛載到了13條染色體。此外，科研團(tuán)隊(duì)結(jié)合轉(zhuǎn)錄組與代謝組聯(lián)合分析，解析了白絹病病原菌侵染白魔芋的分子機(jī)制，初步鑒定了與抗病相關(guān)基因及代謝產(chǎn)物，為白絹病的分子防控提供了新的思路和方向。
白魔芋基因組信息的發(fā)布，為魔芋功能基因組學(xué)研究提供了重要的數(shù)據(jù)資源，為魔芋分子育種提供了寶貴的基因信息。下一步，科研團(tuán)隊(duì)將基于多組學(xué)分析的數(shù)據(jù)，對(duì)相關(guān)基因進(jìn)行功能驗(yàn)證，開(kāi)發(fā)抗病分子標(biāo)記，建立魔芋分子輔助育種體系，為魔芋抗病育種提供更多的技術(shù)支持和理論依據(jù)。
本研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2022YFD1602008）、陜西省農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新項(xiàng)目和安康市科學(xué)技術(shù)研發(fā)計(jì)劃（AK2023-NY-07）等項(xiàng)目資助，研究成果發(fā)表在《Frontiers in Plant Science》期刊。
